تأسس مخبر محطة المعالجة عام 2001 وقد تم رفد المخبر بالأجهزة الحديثة والمتطورة ومن أجل إجراء عدد أوسع من التحاليل كماً ونوعاً ويقوم المخبر بإجراء عدد كبير جداً من التحاليل الكيميائية البيئية منها :
1-تجارب تحديد كفاءة المعالجة للمحطة .
2-تحاليل لبعض المعادن الثقيلة للمياه الداخلة والخارجة .
3-تجارب الآبار البيزومترية .
4-تجارب على الآبار البعيدة المتواجدة حول المحطة.
5-تجارب عن الحمأة المترسبة في الأحواض .
6-تجارب تحديد صلاحية مياه الشرب داخل المحطة.
7-تجارب على عينات خارجية (معامل الأصبغة والدباغات ....).
8-تجارب على عينات مركبة لكافة الأحواض (عينات تتبع ).
9-يقوم المخبر بقطف وتحليل العينات الطارئة والتي يمكن أن تؤخذ في حال تغير مفاجىء في لون المياه .
10-يقوم المخبر بشكل يومي بأخذ القياسات الحقلية للأحواض (درجة الحموضة- الأكسجين المنحل- الناقلية- درجة الحرارة ).
11-تدقيق نتائج المخبر من خلال إجراء تجارب ضبط جودة التحاليل المخبرية .
- وقد حاز مخبر محطة المعالجة على شهادة ضبط جودة التحاليل المخبرية منذ اشتراكه عام 2003 من هيئة الطاقة الذرية ثلاث مرات وذلك ضمن البرنامج الوطني لضبط جودة التحاليل المخبرية ولازال مستمراً حتى الآن .
- تم رفد المخبر حديثاً بجهاز الامتصاص الذري حيث يتم قياس كميات المعادن الثقيلة الواردة الى المحطة والمتواجدة في الأحواض .
وسيتم رفد المخبر بجهاز سبكتروفوتومتر (لقياس الشوارد السالبة والموجبة) وحاضنة جرثومية كما سيتم رفد المخبر بجهاز كروموتوغرافيا كتلوي (لتحليل العناصر المكونة للمركبات الكيميائية مثل مبيدات- فينولات- فيول ....) يتم الإعلان عنه عن طريق المؤسسة العامة لمياه الشرب و الصرف الصحي بحلب بعد أن فوضت الوزارة المؤسسة المذكورة بتأمينه.